В отношении требований о ненадлежащем качестве работ по договору подряда статьей 725 Гражданского кодекса РФ установлен специальный срок исковой давности, который равен одному году, если ненадлежащее качество не выражено в неполном исполнении работ либо в неисполнении их вообще. Также, данный специальный срок исковой давности не распространяется на споры о цене договора подряда и исполнении обязанностей по оплате работ, в противном случае стоит применять общий срок исковой давности, который равен трем годам. Свое течение срок исковой давности начинает со дня, когда лицо, право которого нарушено, узнало о таком нарушении, В Вашем случае срок начинает свое течение с дня когда обнаружены недостатки.