Анатолий, все обращения к работодателю должны быть оформлены документально. Т.е., вам необходимо было написать заявление на имя директора о выплате заработной платы в порядке, который вам более удобен. На данный момент вы не можете документально подтвердить вашу договоренность о выплате вам з/п не на карту банка, выбранного работодателем. Соответственно, оформление вам прогулов работодателем правомерно. Вам необходимо решить данный вопрос с работодателем, например, договориться, что дни невыхода вы оформите, как отпуск за свой счет. Также напишите заявление о выплате вам з/п в том виде, который вам удобен. Если будет резолюция руководителя на вашем заявлении о невозможности таких выплат, можно будет рассмотреть вопрос о правомерности таких действий, на основании фабулы отказа.