Здравствуйте Ирина. Документы на получение паспорта ваш сын обязан был подать в течение 30 дней со дня достижения возраста 14 лет. Поскольку срок пропущен, то действительно необходимо будет заплатить штраф. Спасибо за обращение и всего Вам доброго.