Здравствуйте, Екатерина. Да, вас могут снять с регистрации, так как вы не являетесь членом семьи собственника квартиры. Детей могут выписать позже, по разрешению органов опеки и попечительства, решению суда и зарегистрировать по вашему новому месту регистрации. Всего доброго.