Здравствуйте, Георгий! Первый вопрос Вы сформулировали в самой общей форме. Таким же общим будет и ответ. Определение трудовой дисциплины дано в статье 189 Трудового кодекса РФ (ТК РФ), перечень взысканий за её нарушение и порядок их применения – в статьях 192 и 193 ТК, который легко можно найти в интернете.

Ответ на второй вопрос: указание мастера является неправомерным.

Третий вопрос: согласно статье 99 ТК РФ сверхурочной признаётся работа, выполняемая работником по инициативе работодателя за пределами установленной для работника продолжительности рабочего времени: ежедневной работы (смены). Если бы Вы согласились с требованием мастера и отработали время, на которое опоздали на работу, после окончания смены, эта отработка не выходила бы за пределы нормы рабочего времени, поскольку она носит компенсационный характер (с учётом времени опоздания на работу, которое не засчитывается в рабочее время, продолжительность Вашей работы в этот день осталась бы «нормальной»).

Всего доброго!